Музей истории Свияжска размещается в комплексе казенных сооружений – памятнике архитектуры классицизма. Комплекс построен по типовому проекту административных зданий уездного города XIX века.
Это значимое место для истории Свияжска. В главном здании размещались органы управления и казначейство Свияжского уезда. Три корпуса во дворе занимала уездная тюрьма. В советское время, в 1940-е годы, весь комплекс занимала тюрьма НКВД.
Экспозиция главного здания (корпус № 1) посвящена истории Свияжска, с момента его основания в 1551 году до начала XX века. Важное место отведено истории возникновения и развития свияжских монастырей. Свияжск предстает как очаг духовного подвижничества, начатого святителем Германом-вторым архиепископом Казанским и Свияжским, создаелем свияжского Успенского монастыря.