Сибайский историко-краеведческий музей открылся 24 марта 1959 года как городской школьный музей в кабинете ГК ВЛКСМ г. Сибай. В 1991 году Сибайский историко-краеведческий музей вошел в государственную музейную сеть Башкортостана на правах филиала Национального музея РБ (директор – М. Ф. Музипов).
В 1993 году было выделено новое помещение для музея площадью 1 172,7 квадратных метров по пр. Горняков. В это же время городской музей пополняется экспонатами музея Башкирского медно-серного комбината. В 1998 году состоялось торжественное открытие экспозиционных площадей. 10 октября 2000 года состоялась торжественная презентация нового музея.
Фонды музея насчитывают более 13 тыс. единиц хранения в шести экспозиционных залах: