Здание Музея истории Оренбурга было построено во время второго правления оренбургского генерал-губернатора В. А. Перовского (1851–1857 гг.) в таком стиле, как неоготика (или псевдоготика). Историограф Оренбурга П. П. Столпянский писал в XIX веке, что город Оренбург обязан Перовскому построением чуть ли не трех четвертей всех зданий: Караван-сарай, Контрольная палата, Общественное собрание, дом Казенной палаты, казармы – все построено при Перовском. При Перовском было обращено серьезное внимание и на благоустройство города. Все это объяснялось тем, что Василий Алексеевич стремился придать провинциальному Оренбургу облик столичного города. Во время его правления появляются общественные здания и учреждения, строятся каменные дома, входят в моду балы, городские гулянья.
Музей основан в 1983 году. Это событие было приурочено к 240-летию города Оренбурга. Состоит музей из девяти стационарных экспозиций, рассказывающих об истории города с древнейших времен. Выставки раскрывают такие вопросы, как:
