МУК «Музей новейшей истории города Подольска» был основан 24 декабря 2003 г. Его бессменным директором с самого первого дня является Зеленина Наталья Викторовна.
С момента своего основания музей ведёт активную выставочную деятельность в центре города, а также проводит большую работу по пропаганде исторического наследия города Подольска. Сотрудниками музея проводятся обзорные экскурсии по городу: к месту гибели В. В. Талалихина, к мемориалу Воинской славы в д. Кузовлево, в центр «Бабенская игрушка» и по многим другим маршрутам.
В своей работе музей ориентирован на городскую молодёжь. Ежегодно его сотрудниками проводятся многочисленные мероприятия, в которых учащимся школ предлагается быть не просто зрителями, но и полноправными участниками. Музей придерживается формата открытого и честного диалога с молодым поколением, что позволяет несколько иначе посмотреть на современные проблемы, волнующие молодёжь. Такие интерактивные мероприятия являются особенностью работы музея, отличая его других учреждений культуры города Подольска.
Так же одной из особенностей музея является ежегодное проведение городских выставок на площадке Выставочного зала в период весна-лето. Подобные экспозиции вызывают живой интерес у горожан, поскольку их тематика всегда интереса как взрослым, так и детям. Увлекательные экскурсии, нередко даже игры и мастер-классы – всё это доступно посетителям выставок, организованных музеем.
На сегодняшний день музей не обладает собственным помещением, так как переданная ему усадьба находится на реставрации, поэтому учреждение временно арендует небольшое помещение, что несколько затрудняет доступность музея для посетителей. В связи с этим сотрудники музея успешно проводят передвижные выставки на различных городских площадках и активно участвуют в культурной жизни города.
