Музей был основан в 1962 году. В начале 90-х к музейной экспозиции, расположенной в главном здании, прибавилась еще одна: был куплен расположенный рядом сельский дом постройки конца XIX века, в который удалось собрать мебель и вещи того периода. Дом в комплексе – уникальное строение конца XIX века, которое возводили для дьякона полковой Николаевской церкви Псковского кирасирского полка.
Дом и двор сохранились практически такими же, какими были сельские усадьбы в конце XIX века. В доме много раритета, который больше не встретишь в современной жизни. В экспозиции представлены образцы гончарной посуды, изготовленной из высококачественной местной глины. Собраны разновидности рушников и одежды, характерных для Слобожанщины.
Число музейных предметов основного фонда – 4 101 экспонат. Число предметов научно-вспомогательного фонда – 1 509 экспонатов.
В ноябре 2024 года при поддержке Министерства культуры Российской Федерации в Новопсковском краеведческом музее состоялось открытие детского центра, организованного Российским национальным музеем музыки.
