Музей носит имя одного из основоположников космонавтики, ученого-самоучки Ю.В. Кондратюка (А. И. Шаргея).
С 1993 года музей находится в памятнике истории регионального значения https://m-nsk.ru/portfolio-item/dom-gde-rabotal-yu-v-kondratyuk-ul-sovetskaya-24">«Дом, где работал Ю. В. Кондратюк». В 2017 году здание признали аварийным, но к 2024 году в нем была проведена реконструкция. Во время https://m-nsk.ru/dom-kondratyuka-novaya-glava-v-istorii-zdaniya" target="_blank">реконструкции дом сохранил свой исторический облик и оригинальные декоративные элементы фасада, указан период строительства: 20 августа – 30 ноября 1924 года.
После реконструкции в музее появились новые детали, такие как лестница для посетителей, а также светильники с рисунками Кондратюка. В оконных проемах и в самом здании, благодаря оригинальным техническим решениям, можно увидеть тень великого ученого-самоучки.
В экспозиции музея есть такие интересные экспонаты, как ракетный двигатель, спускаемый аппарат «Зенит-2», модель самолета, испытанная в аэродинамической трубе, фрагмент грузового отсека от самолета «Буран», побывавшего в космосе. Посетители музея также могут увидеть бак отопления с чердака исторического здания и флаг НСО, побывавший в космосе вместе с космонавтом из Новосибирска.
В конференц-зале музея также проводятся экскурсии, кроме того, у посетителей есть возможность посмотреть программы и передачи на тему космоса.
