Ямальский районный музей основан 27 августа 1991 года на основе коллекции школьного музея. Результатом работы музея являются несколько десятков музейных выставок из собственных фондовых коллекций и передвижных выставок из фондов Музейно-выставочного комплекса им. И. С. Шемановского г. Салехарда, сотни статей в газетах и журналах, научных сборниках, археологические и этнографические экспедиции.
В фондовое собрание музея входят фотодокументальные коллекции с архивным фондом письменных источников первых лет советской власти и периода развитого социализма, редкие книги, черно-белые фотографии конца XIX – начала XX века, археологические, естественно-научные (ископаемые останки древних вымерших животных), историко-бытовые и этнографические коллекции, одна из лучших среди музеев Ямало-Ненецкого автономного округа коллекция культовых предметов ямальских ненцев.
За годы музей стал известен не только на Ямале, с ним сотрудничают ученые и музееведы ЯНАО, Москвы, Томска, Екатеринбурга, Барнаула, Тюмени, Тобольска, а также США, Финляндии, Германии.
