Музей был основан в 1976 году. Он знакомит посетителей с жизнью и творчеством Героя Советского Союза, лауреата Ленинской премии, татарского поэта Мусы Джалиля. Расположен на родине героя, на территории одноименного мемориального комплекса в селе Мустафино Шарлыкского района Оренбургской области.
В 2013 году, при поддержке правительств Татарстана и Оренбургской области, президента Татарстана Р. Минниханова и главы Оренбургской области Ю. Берга была проведена масштабная реконструкция народного музея. Были открыты мемориальный комплекс имени М. Джалиля и новая музейная экспозиция, которая включает три зала.
В фондах музея имеются экспонаты, относящиеся к разным периодам жизни поэта и послевоенному изучению его творчества. Ежегодно учреждение принимает тысячи туристов из Оренбуржья, Татарстана, Башкирии, других регионов России и ближнего зарубежья.
