Музей был организован в 1991 году на базе небольшой коллекции музейных предметов, собранных учащимися Аксарковской средней школы, и вырос до многопрофильного научного, культурного учреждения, в фондах которого теперь насчитывается 7 301 единица хранения, в т. ч. основной фонд – 6 093 единицы, научно-вспомогательный – 1 208 единиц. Большую часть фондов составляет этнографическая коллекция, демонстрирующая культуру коренных малочисленных народов Крайнего Севера.
Основной принцип работы музея – сохранение традиционных форм и внедрение творческих инновационных методов. Музей как часть социокультурного пространства занимает активную позицию в вопросах сохранения культурно-исторического наследия района, принимает участие в научной и культурной жизни района и округа. Коллектив музея в тесном контакте работает с учреждениями культуры района, школами, Центром детского творчества.
В музее созданы шесть постоянно действующих экспозиций: «Археология», «Этнография», «Природа», «Зал рыбной промышленности», «Заложники политической системы», «Зал боевой славы». Важное место занимает выставочная деятельность. Музей был инициатором и организатором проведения 2 районных научно-практических конференций.
