Официальное открытие музея театра «Арлекин» состоялось 3 февраля 2006 года.
Коллекция музея постоянно пополняется. Фонды включают фото-, видеоматериалы, афиши, программы, буклеты, режиссерские экспликации, эскизы, пьесы, книги, отзывы, рецензии и так далее. Ценность его состоит в том, что сейчас его коллекция не ограничивается историей Омского театра кукол. На сегодняшний день в фондах музея более 600 кукол. Это куклы Омского театра, Братска, Владикавказа, Вологды, Ижевска, Иркутска, Железногорска, Костромы, Москвы, Новосибирска, Новокузнецка, Томска, Озерска, Улан-Удэ, а также куклы из Болгарии, Великобритании, Индии, Индонезии, Ирана, Казахстана, Китая, Малайзии, Польши, Сербии, Тайваня, Финляндии, Франции, Чехии, Эстонии, Японии.
На сегодняшний день в музее проводятся тематические экскурсии, игровые экскурсионные программы, творческие встречи, конкурсы, презентации, тематические выставки, выставки авторской куклы омских художников. Музей Омского театра кукол молод и как всякий молодой организм находится в состоянии активного поиска своего оригинального творческого почерка, своего места на карте театральных музеев страны.
В 2019 году Музей Омского театра кукол стал победителем всероссийского конкурса в номинации «Лучший притеатральный музей».
