Экспозиции музея знакомят посетителей с историей, традициями и уникальной природой Сынской земли. После переезда у музея появились хранительские помещения, поскольку не все фонды вместились в экспозиционное пространство, получившее название «Река Сыня: мир людей, мир духов, мир природы».
В учреждении ведется научно-исследовательская работа по ряду направлений, в т. ч. изучение забытых ремесел, таких как выделка рыбьих кож, плетение из осоки и кедрового корня, обработка таловой коры и пр. Это позволяет возрождать утраченные традиции и пополнять фонды уникальными экспонатами.
Одним из звеньев в работе музея являлся проект «Живи, река!», который заведующая филиалом Е. И. Тыликова разрабатывала вместе с экологами и археологами из Екатеринбурга и Томска. Проект направлен на изучение исторического наследия Сыни, сохранение экологического равновесия и традиционного образа жизни коренного населения, привлечение внимания общественности к проблемам сохранения уникальной экосистемы Сыни.
Дальнейшее развитие музея видится в качестве Сынского экологического музея, где понятие экологии выходит за рамки естественно-научного и включает в себя также социальный и культурный аспекты. Новая экспозиция разрабатывалась именно в таком ключе.
